RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GGA3Q9NZ52 723 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SUN2Q9UH99 717 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NHSQ6T4R5 1651 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 F8VZ95 297 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CREMQ03060 361 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAPK7Q13164 816 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRC38Q5VT99 294 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZMYND15Q9H091 742 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KBTBD13C9JR72 458 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RIN3Q8TB24 985 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KIF12Q96FN5 646 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 H3BQF6 201 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TTC23LQ6PF05 361 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LCA5Q86VQ0 697 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 IFT43Q96FT9 208 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PMLP29590 882 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PSMD6Q15008 389 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 E2F4Q16254 413 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DPH5Q9H2P9 285 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CYBBP04839 570 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C2orf54Q08AI8 447 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GIPC2Q8TF65 315 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TMEM247A6NEH6 219 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HACD1B0YJ81 288 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KRT14P02533 472 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAP3K7CLP57077 242 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PLD1Q13393 1074 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ITGA9Q13797 1035 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OTUD5Q96G74 571 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.65□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TIMM44O43615 452 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PPFIA2O75334 1257 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FTCDO95954 541 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ACKR2O00590 384 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ESRRGP62508 458 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 BFSP2Q13515 415 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C12orf42Q96LP6 360 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TMCO1Q9UM00 188 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 BTAF1O14981 1849 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 VWA5AO00534 786 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 UNC93AQ86WB7 457 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SPATA18Q8TC71 538 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ALG6Q9Y672 507 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MYO10Q9HD67 2058 aa6.65□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 COBLO75128 1261 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 KLHL2O95198 593 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PRR29P0C7W0 189 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SHMT1P34896 483 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RARRES1P49788 294 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TMEM260Q9NX78 707 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RGL1Q9NZL6 768 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 O00370 1275 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PTK6Q13882 451 aa6.64□□□□□ -1.35
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