RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W POM33Q12164 279 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W HOP09932 586 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RPL30P14120 105 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W AFR1P33304 620 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RPB7P34087 171 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W WSC4P38739 605 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W BAT1P38891 393 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W UIP3P39547 235 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PAC2P39937 518 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W LCL3P53153 274 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YNR048WP53740 393 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PDR17P53844 350 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W HHT1P61830 136 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YDR102CQ03864 110 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YFT2Q06676 274 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W FRE8Q12209 686 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W HUT1Q12520 339 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YPR014CQ6B0W2 109 aa8.95□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YAL064W-BO13512 126 aa8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W LST7P53237 242 aa8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W SWS2P53937 143 aa8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W DAD3P69850 94 aa8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YMR210WQ03649 449 aa8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa8.94□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W URA5P13298 226 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PCL1P24867 279 aa8.93□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W TSA2Q04120 196 aa8.93□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W STP3Q05937 343 aa8.93□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W HUG1Q6Q5K6 68 aa8.93□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W COX5BP00425 151 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W QCR9P22289 66 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W IMG1P25626 169 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W SHB17P36136 271 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W CUE1P38428 203 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YEL057CP39983 233 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W ATF1P40353 525 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W CIS3P47001 227 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YJR115WP47152 169 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W FRQ1Q06389 190 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W STP4Q07351 490 aa8.92□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W FMP49A0A023PZB3 126 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PDX1P16451 410 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W DAL3P32459 195 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YKL097CP34245 136 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YUH1P35127 236 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W CUP9P41817 306 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W MRP51Q02950 344 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W RCE1Q03530 315 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YOR186WQ08560 144 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa8.91□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W TOM1Q03280 3268 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W BET2P20133 325 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W TCA17P32613 152 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YKR073CP36153 106 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W SNO3P43544 222 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W TTI2P47168 421 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W STD1Q02794 444 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YPL039WQ03080 316 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W DAL4Q04895 635 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W COQ11Q05892 277 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W USB1Q12208 290 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YPR071WQ12346 211 aa8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W CCS1P40202 249 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YIL086CP40503 102 aa8.89□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W FRE7Q12333 620 aa8.89□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W POR1P04840 283 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YER010CP40011 234 aa8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W PRM5P40476 318 aa8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W HIT1P46973 164 aa8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W HNT2P49775 206 aa8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W SWM1Q12379 170 aa8.88□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YGL010WP25338 174 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W SRX1P36077 127 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YHR210CP38893 341 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W RPB11P38902 120 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YGR269WP40326 108 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W GPI2P46961 280 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YBR255C-AQ3E776 120 aa8.87□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W DEG1P31115 442 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W DAD2P36162 133 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W SWD3P38123 315 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W PIC2P40035 300 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W COX15P40086 486 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W RPN14P53196 417 aa8.86□□□□□ -0.99
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