RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	APS1	P35181	156 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	UTH1	P36135	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YBR137W	P38276	179 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TIM17	P39515	158 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PEX22	P39718	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YEA4	P40004	342 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	BIR1	P47134	954 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	AIM25	P47140	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ORM1	P53224	222 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ATP23	P53722	227 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YML018C	Q03730	393 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ATG10	Q07879	167 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TIM18	Q08749	192 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HFA1	P32874	2273 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HYM1	P32464	399 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SRY1	P36007	326 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PHD1	P36093	366 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	POP8	P38208	133 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ARN1	P38731	627 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TRR2	P38816	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	CHL4	P38907	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MIC19	P43594	170 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MNN5	P46982	586 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	IKS1	P47042	667 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	UBC12	P52491	188 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TOS8	P53147	276 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PRM8	P53174	237 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YGL034C	P53186	121 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HHO1	P53551	258 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ODC1	Q03028	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	GMC1	Q04399	608 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	FDH1	Q08911	376 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YPR202W	Q08993	238 aa		3.73	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	CDC7	P06243	507 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SPS100	P13130	326 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MSI1	P13712	422 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
KTR2	YKR061W	COQ3	P27680	312 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	URA10	P30402	227 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YMC1	P32331	307 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SCO2	P38072	301 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	APQ12	P40532	138 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YGL101W	P53144	215 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SLM2	P53955	656 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SCS7	Q03529	384 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	EAF3	Q12432	401 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PCL9	Q12477	304 aa		3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	SFK1	P35735	353 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	YBR220C	P38318	560 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	ARN2	P38724	620 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	AIM2	P39721	246 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	OST2	P46964	130 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	SOL1	P50278	321 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	SDT1	P53078	280 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	YGR039W	P53225	103 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	HST4	P53688	370 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	YDR366C	P87287	132 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	IRC15	Q02733	499 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	TMA23	Q03525	211 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	DIC1	Q06143	298 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	ATG39	Q06159	398 aa		3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	SIR2	P06700	562 aa		3.7	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	PHO2	P07269	559 aa		3.7	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
KTR2	YKR061W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms