RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C SDC1Q03323 175 aa3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C GPI17Q04080 534 aa3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C TSA2Q04120 196 aa3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C LOA1Q06508 300 aa3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SNX3Q08826 162 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C THP3Q12049 470 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C GEP5Q12393 293 aa3.13□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SIR2P06700 562 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YBL010CP32788 280 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C PEX2P32800 271 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SFC1P33303 322 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
YKL050CYKL050C PMU1P36069 295 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C HEM14P40012 539 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C APQ12P40532 138 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MNN5P46982 586 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C VPS25P47142 202 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ILM1P47155 203 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C DML1Q03652 475 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YMR206WQ03695 313 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YMR253CQ04835 414 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C FAR10Q06001 478 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ZEO1Q08245 113 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YOR186WQ08560 144 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C PFA4Q12006 378 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C EAF3Q12432 401 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C POP8P38208 133 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C RPS20P38701 121 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YHL049CP38722 271 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C XBP1P40489 647 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SDT1P53078 280 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C CRZ1P53968 678 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C GOT1Q03554 138 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C PSF1Q12488 208 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ATG15P25641 520 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C CTS1P29029 562 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YKL102CP34249 101 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C PAN3P36102 679 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SOL2P37262 315 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C NAT2P37293 288 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MBA1P38300 278 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YHL026CP38740 315 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MED6P38782 295 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C RRT5P43607 289 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C BIR1P47134 954 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SOL1P50278 321 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C LSM3P57743 89 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YPL113CQ02961 396 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C BSP1Q06604 576 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C DGA1Q08650 418 aa3.12□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C STE7P06784 515 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YBR062CP38239 180 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C AYR1P40471 297 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YGR018CP53211 109 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YOL160WQ08321 113 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YPL229WQ99395 206 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C LHP1P33399 275 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YLR177WQ06251 628 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MEC1P38111 2368 aa3.11□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MAG1P22134 296 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C URA10P30402 227 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C PTM1P32857 523 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C GPX1P36014 167 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C OMA1P36163 345 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C COS8P38723 381 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C CHL4P38907 458 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C OST2P46964 130 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C LCB3P47013 409 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C UFD1P53044 361 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C HHO1P53551 258 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C SLM2P53955 656 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C STP22P25604 385 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C OST1P41543 476 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C PAC10P48363 199 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C MDM34P53083 459 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C TPC1P53257 314 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YDR366CP87287 132 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C OSW1Q08692 278 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C BSC1Q12140 328 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C YPR014CQ6B0W2 109 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C CDC7P06243 507 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C DDI2P0CH63 225 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C DDI3P0CH64 225 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C ILV6P25605 309 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL050CYKL050C HYM1P32464 399 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms