RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ALLCQ8N6M5 410 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 UBR7Q8N806 425 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FBF1Q8TES7 1133 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF516Q92618 1163 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CHKBQ9Y259 395 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC42Q9Y546 428 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DENND3A2RUS2 1198 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RASA4BC9J798 803 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NFIBO00712 420 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ALOX15BO15296 676 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MAFGO15525 162 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RASA4O43374 803 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SNX1Q13596 522 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FAM83AQ86UY5 434 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF276Q8N554 614 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 C10orf82Q8WW14 230 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 BSNDQ8WZ55 320 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SAAL1Q96ER3 474 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANK1P16157 1881 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 YDJCA8MPS7 323 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 H0YCG3 227 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ABLIM1O14639 778 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 EXTL3O43909 919 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DCTN3O75935 186 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FAM155BO75949 473 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 IL1BP01584 269 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ITGAVP06756 1048 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 T-ENOLP0DO92 83 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DSG3P32926 999 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GCKP35557 465 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TAS2R40P59535 323 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ATP11AP98196 1134 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 EFHC2Q5JST6 749 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF365Q70YC5 407 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MGARPQ8TDB4 240 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LPAR1Q92633 364 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MAF1Q9H063 256 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DOCK1Q14185 1865 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SPARCL1Q14515 664 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LIN9Q5TKA1 542 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ERICH1Q86X53 443 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GDAP1Q8TB36 358 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MZB1Q8WU39 189 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SAR1AQ9NR31 198 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 E7ESA3 106 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms