RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.65□□□□□ -1.34
SCN2A-209ENST00000636071 AP3S1Q92572 193 aa6.65□□□□□ -1.34
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.65□□□□□ -1.34
SCN2A-209ENST00000636071 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.65□□□□□ -1.34
SCN2A-209ENST00000636071 AHSPQ9NZD4 102 aa6.65□□□□□ -1.34
SCN2A-209ENST00000636071 TBK1Q9UHD2 729 aa6.65□□□□□ -1.34
SCN2A-209ENST00000636071 RNF103O00237 685 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PSTPIP1O43586 416 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PALMO75781 387 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FGAP02671 866 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF18P17022 549 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 VCAM1P19320 739 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DGUOKQ16854 277 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 STKLD1Q8NE28 680 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 BDH2Q9BUT1 245 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CD4P01730 458 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KCNA1Q09470 495 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 USP44Q9H0E7 712 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 WDR41Q9HAD4 459 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PHF11Q9UIL8 331 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MEI4A8MW99 385 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PEX1O43933 1283 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJC6O75061 913 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TNFAIP8O95379 198 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF24P17028 368 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PGBD4Q96DM1 585 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 STK33Q9BYT3 514 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KRT84Q9NSB2 600 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 VPS51Q9UID3 782 aa6.65□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MAGEB2O15479 319 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RHOBTB3O94955 611 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 NPR3P17342 541 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 BTDP43251 543 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GPS1Q13098 491 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 BBS2Q9BXC9 721 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 NEMP1O14524 444 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 JAK2O60674 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 POLG2Q9UHN1 485 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GGA2Q9UJY4 613 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CBFA2T3O75081 653 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GLRA3O75311 464 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ALDH1A2O94788 518 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PPM1NQ8N819 430 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 USE1Q9NZ43 259 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PLCG1P19174 1290 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GRIK1P39086 918 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RFC5P40937 340 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 EXD1Q8NHP7 514 aa6.64□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms