RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 TMC2Q8TDI7 906 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ACAP3Q96P50 834 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 APOL6Q9BWW8 343 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 IPPQ9Y573 584 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ATP8B3O60423 1300 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 H3BQF6 201 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 KIAA0355O15063 1070 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RNF39Q9H2S5 420 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.39■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TIMP1P01033 207 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 AKAP5P24588 427 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CXCR5P32302 372 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 VPS36Q86VN1 386 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FNBP1Q96RU3 617 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.38■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RAG1P15918 1043 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FERP16591 822 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FMO5P49326 533 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PPP3CAQ08209 521 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 USP37Q86T82 979 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FAM84AQ96KN4 292 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PSMB7Q99436 277 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.37■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 LACTBL1A8MY62 500 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CXCL10P02778 98 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TNNI1P19237 187 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 GCLMP48507 274 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 SEPT8Q92599 483 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PARP2Q9UGN5 583 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 NAGPAQ9UK23 515 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 PTPRJQ12913 1337 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 STAT1P42224 750 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ENPEPQ07075 957 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TCTN1Q2MV58 587 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CBWD6Q4V339 395 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ZNF516Q92618 1163 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RGS18Q9NS28 235 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 NENFQ9UMX5 172 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 A0A0U1RQF3 1178 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RECQL4O94761 1208 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 IL18RAPO95256 599 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CLDN10P78369 228 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 SURF1Q15526 300 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 CGRRF1Q99675 332 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 GFPT2O94808 682 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FTCDO95954 541 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RAB27AP51159 221 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 APBB2Q92870 758 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 LPPQ93052 612 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 STK33Q9BYT3 514 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 KLK14Q9P0G3 267 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ZNF623O75123 536 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ZMYND10O75800 440 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ITGA4P13612 1032 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 GJB7Q6PEY0 223 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 VWCEQ96DN2 955 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 ASB7Q9H672 318 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 MED4Q9NPJ6 270 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 RNF19AQ9NV58 838 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-208ENST00000635751 EHD2Q9NZN4 543 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms