RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SV2BQ7L1I2 683 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM170BA6NMN3 283 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP11B2P19099 503 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TKTP29401 623 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCNKBP51801 687 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK6Q16659 721 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PADI6Q6TGC4 694 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ING5Q8WYH8 240 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN23Q96B33 292 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 GDAQ9Y2T3 454 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CDY1Q9Y6F8 540 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BIN1O00499 593 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP6P22004 513 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TARSP26639 723 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 NAMPTP43490 491 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN2BQ14CS0 331 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 UPP1Q16831 310 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB44Q8NCP5 570 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD54LQ92698 747 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 NACC1Q96RE7 527 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BCO2Q9BYV7 579 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 POLD4Q9HCU8 107 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 I3L4J1 428 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL10Q7L3V2 364 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 LUZP1Q86V48 1076 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM9Q9C026 710 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTBN2O15020 2390 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 F5P12259 2224 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BECN2A8MW95 431 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRB5O75023 590 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ECI2O75521 394 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GAT3O94766 335 aa26.23■■□□□ 1.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 FCARP24071 287 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BRCC3P46736 316 aa26.23■■□□□ 1.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 CUL4BQ13620 913 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ECM1Q16610 540 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC15Q8TF66 581 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 HINFPQ9BQA5 517 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 COL4A2P08572 1712 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTLC1O15269 473 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMTOR5O43504 91 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D4O60343 1298 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOBTB3O94955 611 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CEBPBP17676 345 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR4Q5GH76 650 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TANGO2Q6ICL3 276 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 MCRS1Q96EZ8 462 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 EPG5Q9HCE0 2579 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC8B1Q6J4K2 584 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ALKAL1Q6UXT8 129 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP120Q8N960 986 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 DEPTORQ8TB45 409 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 GDE1Q9NZC3 331 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRC4O43908 158 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ABLIM3O94929 683 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R2P41236 205 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA9P43362 315 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ROR1Q01973 937 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SARM1Q6SZW1 724 aa26.2■■□□□ 1.79
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