RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	IL18RAP	O95256	599 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	POU2F2	P09086	479 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	ODC1	P11926	461 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	LILRA4	P59901	499 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADCY1	Q08828	1119 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITFG1	Q8TB96	612 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	HPS3	Q969F9	1004 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	NXPE3	Q969Y0	559 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	SENP8	Q96LD8	212 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	DPP3	Q9NY33	737 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	OAZ2	O95190	189 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEC24A	O95486	1093 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	GART	P22102	1010 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGF13	Q92913	245 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PAX3	P23760	479 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ING5	Q8WYH8	240 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIR	O00625	290 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPTLC1	O15269	473 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	RHO	P08100	348 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CFH	P08603	1231 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPN2	P17706	415 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	AVPR2	P30518	371 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	IER5L	Q5T953	404 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ELMOD1	Q8N336	334 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	FLCN	Q8NFG4	579 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CORO1B	Q9BR76	489 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	OR6C75	A6NL08	312 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	OR4Q2	P0C623	313 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	TYMP	P19971	482 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	HTR4	Q13639	388 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	RESP18	Q5W5W9	173 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANO9	A1A5B4	782 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	EXTL3	O43909	919 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	TAF6	P49848	677 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	IQCE	Q6IPM2	695 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIX5	Q8N196	739 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAFF	Q9ULX9	164 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANHX	E9PGG2	379 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	RFX1	P22670	979 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	AFM	P43652	599 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	TWF1	Q12792	350 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PARM1	Q6UWI2	310 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	METTL23	Q86XA0	190 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRRX2	Q99811	253 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK25	O00506	426 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYB561D2	O14569	222 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	SRF	P11831	508 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	CASP1	P29466	404 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTSS1L	Q765P7	747 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	DSE	Q9UL01	958 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SEMA3B-215	ENST00000621029	SV2C	Q496J9	727 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPD1L	Q8N335	351 aa		31.32	■■■□□ 2.6

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