RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM161B	Q96MY7	647 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	CDH16	O75309	829 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP11B1	P15538	503 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	IL17A	Q16552	155 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MAPK7	Q13164	816 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TPI1	P60174	286 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AP2B1	P63010	937 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC22	O60826	627 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NPTX2	P47972	431 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	OCRL	Q01968	901 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SP110	Q9HB58	689 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC25A27	O95847	323 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CDC42EP1	Q00587	391 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PID1	Q7Z2X4	250 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM66	O15016	1216 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CYTH3	O43739	400 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GRAP2	O75791	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PTK7	Q13308	1070 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KYNU	Q16719	465 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TYK2	P29597	1187 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SEC24C	P53992	1094 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	L1RE1	Q9UN81	338 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM86B1	E9PN63	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM107A	O95990	144 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SERPINB12	Q96P63	405 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MED15	Q96RN5	788 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEB2	O15479	319 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP9B	O43861	1147 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RSAD1	Q9HA92	442 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	APRT	P07741	180 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT10	P13645	584 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RAD23B	P54727	409 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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