RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MAP4K3Q8IVH8 894 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF687Q8N1G0 1237 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB44Q8NCP5 570 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ATRIPQ8WXE1 791 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 NELL1Q92832 810 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN32Q9NX65 697 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 H0YCG3 227 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MAN2B1O00754 1011 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 CYP3A5P20815 502 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.943e-8■■■■■ 82.4
PTPRF-216ENST00000617451 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 VITQ6UXI7 678 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 IRF7Q92985 503 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 KIF12Q96FN5 646 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TRPV4Q9HBA0 871 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TRPV5Q9NQA5 729 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ASAH2Q9NR71 780 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 VNN2O95498 520 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 MYL4P12829 197 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PSMC3P17980 439 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF9P41273 254 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf34Q49A92 452 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 BICD1Q96G01 975 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 LACTBL1A8MY62 500 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GJA1P17302 382 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 VIPR2P41587 438 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 MTAPQ13126 283 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 KYAT1Q16773 422 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 ODF2LQ9ULJ1 636 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 YIPF1Q9Y548 306 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 FAM189A1O60320 539 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 LILRB5O75023 590 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GDI1P31150 447 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R3AQ06190 1150 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 RABEP1Q15276 862 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 TSSK4Q6SA08 328 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C75A6NL08 312 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A4O43511 780 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 ADRB2P07550 413 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 OR4Q2P0C623 313 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 SCP2P22307 547 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 LIG4P49917 911 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 TEAD2Q15562 447 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 MAMSTRQ6ZN01 415 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 USP37Q86T82 979 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 MFSD6LQ8IWD5 586 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 SHKBP1Q8TBC3 707 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 AK8Q96MA6 479 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PGLYRP2Q96PD5 576 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 REEP2Q9BRK0 252 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC3Q9BY71 257 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GPR88Q9GZN0 384 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 EPC1Q9H2F5 836 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 CHRDQ9H2X0 955 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 CRISPLD1Q9H336 500 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 TBX20Q9UMR3 447 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 OGTO15294 1046 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PIGRP01833 764 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GUCY2FP51841 1108 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP4Q13115 394 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GPR17Q13304 367 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PLD1Q13393 1074 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 DSTYKQ6XUX3 929 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC25Q9H1X3 360 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 DLL3Q9NYJ7 618 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 NCDNQ9UBB6 729 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 PIAS3Q9Y6X2 628 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 NCANO14594 1321 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 COL4A2P08572 1712 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 H3BQV1 296 aa27.08■■□□□ 1.93
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PTPRF-216ENST00000617451 TYMPP19971 482 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GJB2P29033 226 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 GPBP1Q86WP2 473 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 TMC8Q8IU68 726 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC15Q8TF66 581 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 FAM3CQ92520 227 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 E2F7Q96AV8 911 aa27.08■■□□□ 1.93
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