RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	RAD9A	Q99638	391 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	IDI2	Q9BXS1	227 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	DTL	Q9NZJ0	730 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	NUDC	Q9Y266	331 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		6	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	MYO10	Q9HD67	2058 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GTL3	188 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	C19orf81	C9J6K1	198 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PDPK1	O15530	556 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	STRN	O43815	780 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	BAIAP3	O94812	1187 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CSF1R	P07333	972 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ATP2B1	P20020	1258 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	GPR85	P60893	370 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SHC2	P98077	582 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PLS1	Q14651	629 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	NTRK3	Q16288	839 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	LNPK	Q9C0E8	428 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SIPA1L1	O43166	1804 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768		H3BNC9	293 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	WNT9A	O14904	365 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PRODH	O43272	600 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	NCK2	O43639	380 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CYP7B1	O75881	506 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	EYA4	O95677	639 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	AOC1	P19801	751 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PTGS1	P23219	599 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	GJA9	P57773	515 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	TCTN1	Q2MV58	587 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	USP53	Q70EK8	1073 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP53	Q96M91	514 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM209	Q96SK2	561 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SPC25	Q9HBM1	224 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	MCM3AP	O60318	1980 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SLC30A4	O14863	429 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CTAGE5	O15320	804 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	LRG1	P02750	347 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ASNS	P08243	561 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	IQCF3	P0C7M6	154 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	FCER1A	P12319	257 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	VCAM1	P19320	739 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	RFC2	P35250	354 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM9	Q13443	819 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM15	Q13444	863 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	SERINC3	Q13530	473 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	GCKR	Q14397	625 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	FEZ1	Q99689	392 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MLH1-223	ENST00000616768	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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