RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592354.5

CAPNS1-213, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-213ENST00000592354 GJA1P17302 382 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-213ENST00000592354 FCARP24071 287 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-213ENST00000592354 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-213ENST00000592354 ACOT2P49753 483 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-213ENST00000592354 STARD6P59095 220 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-213ENST00000592354 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-213ENST00000592354 CUL4AQ13619 759 aa14.66□□□□□ -0.06
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CAPNS1-213ENST00000592354 KCNN1Q92952 543 aa14.66□□□□□ -0.06
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CAPNS1-213ENST00000592354 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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CAPNS1-213ENST00000592354 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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CAPNS1-213ENST00000592354 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.64□□□□□ -0.07
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CAPNS1-213ENST00000592354 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.64□□□□□ -0.07
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CAPNS1-213ENST00000592354 MOSPD3O75425 235 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SOAT2O75908 522 aa14.63□□□□□ -0.07
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CAPNS1-213ENST00000592354 MTMR11A4FU01 709 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MYMKA6NI61 221 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 OR6C75A6NL08 312 aa14.62□□□□□ -0.07
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CAPNS1-213ENST00000592354 ABCD1P33897 745 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 TXLNAP40222 546 aa14.62□□□□□ -0.07
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