RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 PATJQ8NI35 1801 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TBC1D4O60343 1298 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 URODP06132 367 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TYMPP19971 482 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 FMO5P49326 533 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 GLUD2P49448 558 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF165P49910 485 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CREMQ03060 361 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 MYO1EQ12965 1108 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ADGRE1Q14246 886 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 IQCB1Q15051 598 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 PTPROQ16827 1216 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 USP41Q3LFD5 358 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SV2CQ496J9 727 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 RTP2Q5QGT7 225 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 KRT39Q6A163 491 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 VPS52Q8N1B4 723 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 POF1BQ8WVV4 589 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 RABGGTAQ92696 567 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TTPALQ9BTX7 342 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CERS4Q9HA82 394 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 FNIP2Q9P278 1114 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 MTRRQ9UBK8 725 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TTC28Q96AY4 2481 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 KPNA7A9QM74 516 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNJ18B7U540 433 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TADA2AO75478 443 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 OAZ2O95190 189 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 PAPLNO95428 1278 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 HLA-DRAP01903 254 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM163BP0C2L3 166 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ODC1P11926 461 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 BRCC3P46736 316 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 GCLMP48507 274 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ERVFC1P60507 584 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 NCOA4Q13772 614 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNJ12Q14500 433 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 MAN2A1Q16706 1144 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CBWD6Q4V339 395 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 MIIPQ5JXC2 388 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 Q7L0L9 218 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 DPH6Q7L8W6 267 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 APPL2Q8NEU8 664 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 LMO3Q8TAP4 145 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 HASPINQ8TF76 798 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 HPDLQ96IR7 371 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SENP8Q96LD8 212 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 TCF25Q9BQ70 676 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 BCO2Q9BYV7 579 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 DSEQ9UL01 958 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 L1RE1Q9UN81 338 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-221ENST00000591856 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms