RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC2Q9BYS8 371 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CLIP2Q9UDT6 1046 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NR2E1Q9Y466 385 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 EFCAB14O75071 495 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 MBD4O95243 580 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SMC2O95347 1197 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NTSR2O95665 410 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CRTAMO95727 393 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 AMHP03971 560 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 LDHCP07864 332 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 FAM153BP0C7A2 387 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 KIF5BP33176 963 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 PHKA1P46020 1223 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 TRAPPC10P48553 1259 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 GNAQP50148 359 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 JAM2P57087 298 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ANTXR2P58335 489 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 GSTO1P78417 241 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 IL13RA1P78552 427 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CHRNDQ07001 517 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NFYCQ13952 458 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RNF151Q2KHN1 245 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 KRT40Q6A162 431 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CHST3Q7LGC8 479 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC186Q7Z3E2 898 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 LUZP1Q86V48 1076 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 FUKQ8N0W3 1084 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 MLKLQ8NB16 471 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 FANCBQ8NB91 859 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC112Q8NEF3 446 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 FERMT2Q96AC1 680 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ARMC5Q96C12 935 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 MAP3K14Q99558 947 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 BTBD2Q9BX70 525 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 LY9Q9HBG7 655 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 BTBD7Q9P203 1132 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 B4E1Z4 1266 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 FOXP2O15409 715 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP6O43182 974 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SUV39H1O43463 412 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CDC14BO60729 498 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RPS6KA4O75676 772 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 BAG3O95817 575 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 MMP1P03956 469 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CALML3P27482 149 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 DNM2P50570 870 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFA8P51970 172 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 HMGA2P52926 109 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 TUBB4BP68371 445 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 PPARAQ07869 468 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 SBK1Q52WX2 424 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RESP18Q5W5W9 173 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 GALNT17Q6IS24 598 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC8AQ8IWT6 810 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 C8orf37Q96NL8 207 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 TOMM22Q9NS69 142 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 RAI14Q9P0K7 980 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 NARFQ9UHQ1 456 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 TUBE1Q9UJT0 475 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 HPSEQ9Y251 543 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.11□□□□□ -1.59
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