RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-214ENST00000582717 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ECEL1O95672 775 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 MOGSQ13724 837 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CHADLQ6NUI6 762 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 AADACL2Q6P093 401 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 FAM84AQ96KN4 292 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 FGD4Q96M96 766 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TMEM120BA0PK00 339 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CXCL11O14625 94 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 WFS1O76024 890 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PGK2P07205 417 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 COMTP21964 271 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 GLRA2P23416 452 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PAX7P23759 505 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 KRT39Q6A163 491 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 GPD1LQ8N335 351 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TMC2Q8TDI7 906 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CD101Q93033 1021 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SYT17Q9BSW7 474 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TRIM7Q9C029 511 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CCDC189A1A4V9 331 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TCEA3O75764 348 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 GARTP22102 1010 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 MARCKSL1P49006 195 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PPIL2Q13356 520 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ASRGL1Q7L266 308 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PLVAPQ9BX97 442 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PORCNQ9H237 461 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 LRRC19Q9H756 370 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SOCS7O14512 581 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 NEBLO76041 1014 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ARIH2O95376 493 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 POTEJP0CG39 1038 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ARL2P36404 184 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CCNG1P51959 295 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ATP11AP98196 1134 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 LY6KQ17RY6 165 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 Q3C1V9 767 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CCDC38Q502W7 563 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 RNF43Q68DV7 783 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 VSTM1Q6UX27 236 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CCDC25Q86WR0 208 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.48□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 MCM3APO60318 1980 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 H0YCG3 227 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 PYGMP11217 842 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 GZMAP12544 262 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ITIH2P19823 946 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 MAN1A1P33908 653 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 LIG4P49917 911 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 GPC3P51654 580 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 CAV1Q03135 178 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 20.4
GGA3-214ENST00000582717 MESDQ14696 234 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 SV2AQ7L0J3 742 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 HELQQ8TDG4 1101 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 OPTNQ96CV9 577 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ACP6Q9NPH0 428 aa14.47□□□□□ -0.09
GGA3-214ENST00000582717 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms