RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	IPP	Q9Y573	584 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	USP16	Q9Y5T5	823 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MTSS1	O43312	755 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PLIN1	O60240	522 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA10	O75578	1167 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RFPL1	O75677	317 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	STC2	O76061	302 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PLAT	P00750	562 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	POU2F2	P09086	479 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PDC	P20941	246 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ECHS1	P30084	290 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	NPEPPS	P55786	919 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MGAT2	Q10469	447 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MDM1	Q8TC05	714 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	KAT5	Q92993	513 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	IL23A	Q9NPF7	189 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	BCL9	O00512	1426 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ANXA1	P04083	346 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	A1BG	P04217	495 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GYPE	P15421	78 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	VCAM1	P19320	739 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2C19	P33261	490 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN7	P35236	360 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SREBF1	P36956	1147 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	WAS	P42768	502 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A9	P48067	706 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	WNT3A	P56704	352 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	G2E3	Q7L622	706 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	C14orf80	Q86SX3	495 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	HDAC10	Q969S8	669 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	OR14A2	Q96R54	314 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TCF25	Q9BQ70	676 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	WNT10B	O00744	389 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GPR42	O15529	346 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	AP1G1	O43747	822 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP5	P24588	427 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	APBA1	Q02410	837 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP8	Q13202	625 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FZD5	Q13467	585 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ITPK1	Q13572	414 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MLC1	Q15049	377 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.49	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms