RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BMP4-208	ENST00000559642	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CLIC2	O15247	247 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	PAPLN	O95428	1278 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ASGR2	P07307	311 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CYP2J2	P51589	502 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	SEC24A	O95486	1093 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ITGB3	P05106	788 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ODC1	P11926	461 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CPB1	P15086	417 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	TAF6	P49848	677 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	STK4	Q13043	487 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	USP37	Q86T82	979 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	MYADM	Q96S97	322 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	PRRG1	O14668	218 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ABLIM3	O94929	683 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF202	O95125	648 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	OAZ2	O95190	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	TYMP	P19971	482 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	HOXA9	P31269	272 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CYB561D2	O14569	222 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	GPR37L1	O60883	481 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	XYLB	O75191	536 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	VNN2	O95498	520 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	KRT19	P08727	400 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ATF2	P15336	505 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ELF1	P32519	619 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CDR1	P51861	262 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ZXDA	P98168	799 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	DPYD	Q12882	1025 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	BFSP1	Q12934	665 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	SV2C	Q496J9	727 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BMP4-208	ENST00000559642	EDA	Q92838	391 aa		13.92	□□□□□ -0.18

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