RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT13P13646 458 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 AP3M2P53677 418 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 RBP5P82980 135 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 NELFBQ8WX92 580 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 H7C4K7 107 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 SPTLC1O15269 473 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 GLUD1P00367 558 aa20.34■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.34■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 DPP7Q9UHL4 492 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.33■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF516Q92618 1163 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 HPDLQ96IR7 371 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 CD207Q9UJ71 328 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 CYB561D2O14569 222 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 OAZ2O95190 189 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP11A1P05108 521 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 OR1D2P34982 312 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPC3Q13507 836 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.31■□□□□ 0.84
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