RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 USP28Q96RU2 1077 aa23.57■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 PANK2Q9BZ23 570 aa23.57■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.57■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 MYMKA6NI61 221 aa23.56■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 TISP43B9A030 160 aa23.56■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 GFRA3O60609 400 aa23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 NFICP08651 508 aa23.56■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 IDEP14735 1019 aa23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 GAP43P17677 238 aa23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 SLC39A14Q15043 492 aa23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 HVCN1Q96D96 273 aa23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 DERAQ9Y315 318 aa23.56■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.56■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 DOCK6Q96HP0 2047 aa23.55■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 PPEF2O14830 753 aa23.54■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 STK38Q15208 465 aa23.54■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.54■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 SENP8Q96LD8 212 aa23.54■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 ACCSQ96QU6 501 aa23.54■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.54■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 MYL4P12829 197 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 TYMPP19971 482 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 ASAH2Q9NR71 780 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 CEP72Q9P209 647 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 C2CD2Q9Y426 696 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.53■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 ECI2O75521 394 aa23.52■■□□□ 1.36
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CIPC-208ENST00000557115 LEMD2Q8NC56 503 aa23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 FOXQ1Q9C009 403 aa23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 DPP3Q9NY33 737 aa23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 YIPF1Q9Y548 306 aa23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 CACNA1HO95180 2353 aa23.52■■□□□ 1.36
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R37O75864 691 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 MICAL2O94851 1124 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 IL18RAPO95256 599 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 EPHB3P54753 998 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 STARD6P59095 220 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 PRKCQQ04759 706 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 KCNA1Q09470 495 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 DUSP4Q13115 394 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 GPR17Q13304 367 aa23.51■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 MYBPC2Q14324 1141 aa23.51■■□□□ 1.35
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CIPC-208ENST00000557115 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.51■■□□□ 1.35
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CIPC-208ENST00000557115 PIRO00625 290 aa23.5■■□□□ 1.35
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CIPC-208ENST00000557115 ADSSP30520 456 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CCR2P41597 374 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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CIPC-208ENST00000557115 PJA1Q8NG27 643 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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