RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 DEXIO95424 95 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 EGFP01133 1207 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LRG1P02750 347 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CAPNS1P04632 268 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TXKP42681 527 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM193AP78312 1265 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CREMQ03060 361 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MESP2Q0VG99 397 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ST3GAL1Q11201 340 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TFDP1Q14186 410 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM187BQ17R55 369 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC142Q17RM4 750 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF20Q5VTR2 975 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CEP68Q76N32 757 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HHIPQ96QV1 700 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB23Q9ULC3 237 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 YIPF1Q9Y548 306 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LNP1A1A4G5 178 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 BTBD18B2RXH4 712 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ACKR2O00590 384 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MAN2B1O00754 1011 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LRP3O75074 770 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ARSAP15289 507 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ATP2B1P20020 1258 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 BCKDHBP21953 392 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MPLP40238 635 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LIMK1P53667 647 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NRLP54845 237 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DUSP4Q13115 394 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NBR1Q14596 966 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PLK5Q496M5 336 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 IL31Q6EBC2 164 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RUFY3Q7L099 469 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNK18Q7Z418 384 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NECAB1Q8N987 351 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GAB3Q8WWW8 586 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 IRF7Q92985 503 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM84AQ96KN4 292 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 IL21Q9HBE4 155 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KLK13Q9UKR3 277 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PPME1Q9Y570 386 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SFI1A8K8P3 1242 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 N4BP3O15049 544 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 JAK2O60674 1132 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC45O75419 566 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ATF6P18850 670 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR15P49685 360 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MAPK7Q13164 816 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KRT32Q14532 448 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PADI6Q6TGC4 694 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 BEST2Q8NFU1 509 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX12PQ92771 950 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms