RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MTRRQ9UBK8 725 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SYN3O14994 580 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TRAPPC3O43617 180 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ADH1AP07327 375 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SPATA31D3P0C874 917 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 IL9P15248 144 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TAF6P49848 677 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 BFSP1Q12934 665 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SURF1Q15526 300 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CENPPQ6IPU0 288 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 PALB2Q86YC2 1186 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CASP10Q92851 521 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 BORCS6Q96GS4 357 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SENP8Q96LD8 212 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ZNF560Q96MR9 790 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 FNBP1Q96RU3 617 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 FNIP2Q9P278 1114 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 A0A0C4DFX4 3053 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 WDR27A2RRH5 827 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 KPNA7A9QM74 516 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 PSMA7O14818 248 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MBTPS2O43462 519 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TGM5O43548 720 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 NCK2O43639 380 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 GLUD1P00367 558 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TNNC2P02585 160 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 WEE2P0C1S8 567 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 OR4Q2P0C623 313 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TRIM49P0CI25 452 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TRIM49CP0CI26 452 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ODC1P11926 461 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CCNE1P24864 410 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 OR1D2P34982 312 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CDR1P51861 262 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ARPP19P56211 112 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 STX17P56962 302 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ROR1Q01973 937 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ADAM9Q13443 819 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MYBPC2Q14324 1141 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SV2CQ496J9 727 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 GPR65Q8IYL9 337 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 NELFBQ8WX92 580 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 ASB2Q96Q27 587 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TMEM209Q96SK2 561 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TSG101Q99816 390 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CD207Q9UJ71 328 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 FSD2A1L4K1 749 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 CYB561D2O14569 222 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 HCRTO43612 131 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 TBC1D4O60343 1298 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-211ENST00000548041 RFPL2O75678 378 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms