RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CLEC11AQ9Y240 323 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 NPHP3Q7Z494 1330 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 C2orf78A6NCI8 922 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 RIPK2O43353 540 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FCER2P06734 321 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PCSK2P16519 638 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF12P17014 697 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GNAT2P19087 354 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 DGKAP23743 735 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ALDH3B1P43353 468 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZAP70P43403 619 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ADCY7P51828 1080 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GSTO1P78417 241 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 LAMB3Q13751 1172 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FANCBQ8NB91 859 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 RSAD2Q8WXG1 361 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GLG1Q92896 1179 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CDCA5Q96FF9 252 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 DPY30Q9C005 99 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 C8orf4Q9NR00 106 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PCDH10Q9P2E7 1040 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 H0YCG3 227 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PJA2O43164 708 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNQ3O43525 872 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC22O60826 627 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TOM1L1O75674 476 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FESP07332 822 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 NR4A1P22736 598 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 HSD17B2P37059 387 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 MAGEA3P43357 314 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CLCN5P51795 746 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CAV1Q03135 178 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TFDP2Q14188 446 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL35Q6PF15 583 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FAR1Q8WVX9 515 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 RADILQ96JH8 1075 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SPASTQ9UBP0 616 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SPACA6W5XKT8 324 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 KIF21BO75037 1637 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 C9IYK1 514 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC7O00311 574 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SHOXO15266 292 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SSX4O60224 188 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 HUS1O60921 280 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SIN3BO75182 1162 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 STARD3NLO95772 234 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 NPIPA8P0DM63 369 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GTF2H1P32780 548 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GJA9P57773 515 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ACAD11Q709F0 780 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC37L1Q7L3B6 337 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM172AQ8WUF8 416 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 E2F7Q96AV8 911 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 DSN1Q9H410 356 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 RUBCNLQ9H714 662 aa3.29□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms