RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 GCNT3O95395 438 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 GUCY2FP51841 1108 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ALCAMQ13740 583 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 GPR152Q8TDT2 470 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 FGF14Q92915 247 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 CORO1BQ9BR76 489 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 C2CD2Q9Y426 696 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 SPTLC2O15270 562 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 SEC24AO95486 1093 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ODC1P11926 461 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 NPR3P17342 541 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TYMPP19971 482 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 LILRA4P59901 499 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ING5Q8WYH8 240 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PIEZO1Q92508 2521 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 SHDQ96IW2 340 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PANK4Q9NVE7 773 aa21.93■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PPP6R2O75170 966 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 IL18RAPO95256 599 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 NFICP08651 508 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PFKPQ01813 784 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PLD1Q13393 1074 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PDILTQ8N807 584 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 LEMD2Q8NC56 503 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 DSEQ9UL01 958 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 KRBA1A5PL33 1030 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TISP43B9A030 160 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PPP1R37O75864 691 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 MICAL2O94851 1124 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 GPC5P78333 572 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 AMPD3Q01432 767 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TWF1Q12792 350 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 MYBPC2Q14324 1141 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 METTL23Q86XA0 190 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 SENP8Q96LD8 212 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 STRA6Q9BX79 667 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TMEM206Q9H813 350 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 DPP3Q9NY33 737 aa21.91■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PIRO00625 290 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PI15O43692 258 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 YEATS4O95619 227 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ALDH1A3P47895 512 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 GPR17Q13304 367 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 KXD1Q9BQD3 176 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TNMDQ9H2S6 317 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 CUEDC2Q9H467 287 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ASAH2Q9NR71 780 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ANO9A1A5B4 782 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ECI2O75521 394 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ADSSP30520 456 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TAF6P49848 677 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 EPHB3P54753 998 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 IQUBQ8NA54 791 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PHOX2BQ99453 314 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.89■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 A0A087X0B3 334 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PPEF2O14830 753 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CUTAO60888 179 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 OR4Q2P0C623 313 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 MYL4P12829 197 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CEBPBP17676 345 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms