RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PSEN2P49810 448 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 LAMB3Q13751 1172 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 WDR48Q8TAF3 677 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 VTA1Q9NP79 307 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 SELENONQ9NZV5 590 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 FAM205CA6NFA0 338 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 PPFIA2O75334 1257 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFS3O75489 264 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 ALDH1A2O94788 518 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 CHRNA3P32297 505 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 NOGQ13253 232 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 CD302Q8IX05 232 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 DDIASQ8IXT1 998 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 MAP3K14Q99558 947 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRB-204ENST00000538708 AP3B1O00203 1094 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ATP1A3P13637 1013 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCT5P48643 541 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DDI1Q8WTU0 396 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 OCM2P0CE71 109 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GPD1P21695 349 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ACAD11Q709F0 780 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PKP3Q9Y446 797 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MSCO60682 206 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GHRP10912 638 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SLC2A3P11169 496 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SLC1A1P43005 524 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 BEX3Q00994 111 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CAV1Q03135 178 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DGKZQ13574 1117 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PPM1NQ8N819 430 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DPF2Q92785 391 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2H1P32780 548 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FMO5P49326 533 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GMCL1Q96IK5 515 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 VWA5AO00534 786 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 KITP10721 976 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 NAMPTP43490 491 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TMPRSS15P98073 1019 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 STARD3Q14849 445 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 METTL7BQ6UX53 244 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SNX24Q9Y343 169 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 H3BRB1 525 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 NFIBO00712 420 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MGEA5O60502 916 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CHGBP05060 677 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 KCNA2P16389 499 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP99D6REC4 459 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CABYRO75952 493 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SLC26A2P50443 739 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PGM5Q15124 567 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms