RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515129.5

SEMA6A-215, Transcript of semaphorin 6A, human

TSL 2

Gene SEMA6A, Length 2,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA6A-215	ENST00000515129	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	COG5	Q9UP83	839 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ATG7	O95352	703 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CYP1A2	P05177	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CHRNB2	P17787	502 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CYP2C18	P33260	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	RFC5	P40937	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	NAMPT	P43490	491 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ARHGAP1	Q07960	439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PSMD6	Q15008	389 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	DEFB123	Q8N688	67 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129		K7ERI5	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ZEB2	O60315	1214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ITGA4	P13612	1032 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	KRT5	P13647	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CSF2RA	P15509	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	GBP1	P32455	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	FMO1	Q01740	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	FPGS	Q05932	587 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TTLL4	Q14679	1199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MESD	Q14696	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	GPR153	Q6NV75	609 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ZNF677	Q86XU0	584 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SPOP	O43791	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MME	P08473	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ACR	P10323	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TNNI1	P19237	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CPT1A	P50416	773 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CLDN10	P78369	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	DR1	Q01658	176 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	NEDD9	Q14511	834 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	KAT2B	Q92831	832 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TTI1	O43156	1089 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PIGR	P01833	764 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MYBL1	P10243	752 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TGFB3	P10600	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	COMT	P21964	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	CHRNA3	P32297	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA6A-215	ENST00000515129	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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