RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 CTSAP10619 480 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FGFR3P22607 806 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 DNAJB1P25685 340 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 BRCC3P46736 316 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FMO5P49326 533 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MXI1P50539 228 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MYL6P60660 151 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TPM4P67936 248 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CAMK1Q14012 370 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MAN2A1Q16706 1144 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 PTPROQ16827 1216 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 SV2CQ496J9 727 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CBWD6Q4V339 395 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 VWA3BQ502W6 1294 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 DPH6Q7L8W6 267 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 APPL2Q8NEU8 664 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 HASPINQ8TF76 798 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 SENP8Q96LD8 212 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TTPALQ9BTX7 342 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TLR9Q9NR96 1032 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 RAB20Q9NX57 234 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 IRAK3Q9Y616 596 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 LAMA3Q16787 3333 aa8.75□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 I3L4J1 428 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 RFXAPO00287 272 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CYB561D2O14569 222 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 FSCN2O14926 492 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 LILRB3O75022 631 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 OAZ2O95190 189 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CXCL14O95715 111 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 HLA-DRAP01903 254 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CYP11A1P05108 521 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TPM2P07951 284 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TYMPP19971 482 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 ERVFC1P60507 584 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 DSG1Q02413 1049 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 KRT31Q15323 416 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 WDR44Q5JSH3 913 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MIIPQ5JXC2 388 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 PDXDC1Q6P996 788 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TMC7Q7Z402 723 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 LUZP1Q86V48 1076 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CEP57Q86XR8 500 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TCF25Q9BQ70 676 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 ZBP1Q9H171 429 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 NDST4Q9H3R1 872 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 DSEQ9UL01 958 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.74□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 H7C4K7 107 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 HUS1O60921 280 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 URODP06132 367 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 ODC1P11926 461 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 P4HA1P13674 534 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 PIK3CAP42336 1068 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 GLUD2P49448 558 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 MYL7Q01449 175 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 CREMQ03060 361 aa8.73□□□□□ -1.01
ABCD4-216ENST00000493752 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms