RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493583.5

TFE3-204, Transcript of transcription factor binding to IGHM enhancer 3, humanhuman

TSL 2

Gene TFE3, Length 3,279 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3-204ENST00000493583 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 GSTA1P08263 222 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ADSSP30520 456 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 STAT2P52630 851 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SPP2Q13103 211 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 TFDP1Q14186 410 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 EML3Q32P44 896 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CEP55Q53EZ4 464 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 PTPRN2Q92932 1015 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 FAM20AQ96MK3 541 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 NACC1Q96RE7 527 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 DCLK3Q9C098 648 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZWILCHQ9H900 591 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZFATQ9P243 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 PSMD10O75832 226 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 FAM155BO75949 473 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 USP1O94782 785 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ITGB5P18084 799 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 MTFR1Q15390 333 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 BBS9Q3SYG4 887 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 USP6NLQ92738 828 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 TTC1Q99614 292 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 MECRQ9BV79 373 aa14.61□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 STRN3Q13033 797 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SV2AQ7L0J3 742 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CD101Q93033 1021 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 DENND3A2RUS2 1198 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ATP9AO75110 1047 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 POLR2MP0CAP2 368 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 DPEP1P16444 411 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 GAP43P17677 238 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 RXRBP28702 533 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 DSG3P32926 999 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 RPS6KA3P51812 740 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 KDSRQ06136 332 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 FAXCQ5TGI0 409 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 MAML1Q92585 1016 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SERPINB12Q96P63 405 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SMC6Q96SB8 1091 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 MIPEPQ99797 713 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 GINM1Q9NU53 330 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 HEY2Q9UBP5 337 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 F8VP50 259 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CDH16O75309 829 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 AVILO75366 819 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 TPBGLP0DKB5 382 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CYP3A7P24462 503 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SERPINB3P29508 390 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 P3H4Q92791 437 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 COL20A1Q9P218 1284 aa14.6□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 LRRD1A4D1F6 860 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 FDX1P10109 184 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CNGA1P29973 690 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 SPARCL1Q14515 664 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 Q4G0T1 1027 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 ASRGL1Q7L266 308 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 CCDC125Q86Z20 511 aa14.59□□□□□ -0.07
TFE3-204ENST00000493583 NETO2Q8NC67 525 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms