RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SEMA4DQ92854 862 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 TMEM143Q96AN5 459 aa7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 ELNP15502 786 aa7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EXOC4Q96A65 974 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.51□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.5□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.5□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 TRIM60Q495X7 471 aa7.5□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 DPH5Q9H2P9 285 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 OBSL1O75147 1896 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MMEP08473 750 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 IQCF3P0C7M6 154 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 PAX7P23759 505 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MARCKSL1P49006 195 aa7.5□□□□□ -1.21
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