RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	NFIA	Q12857	509 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	HIC2	Q96JB3	615 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC7B	Q86TV6	843 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMG1	O95456	288 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PRELP	P51888	382 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIP10	Q15642	601 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT39	Q6A163	491 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	IRGC	Q6NXR0	463 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	RFX6	Q8HWS3	928 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292		H7C0C1	242 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC6	O75061	913 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	GM2A	P17900	193 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP5O	P48047	213 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SOX10	P56693	466 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	AP2B1	P63010	937 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	NR1H3	Q13133	447 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	GRAP	Q13588	217 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ACADS	P16219	412 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ASPH	Q12797	758 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TEKT1	Q969V4	418 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF711	Q9Y462	761 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	FCHO1	O14526	889 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ARL4C	P56559	192 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP4C	P60510	307 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	LMNB2	Q03252	620 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	RASA2	Q15283	850 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	MMEL1	Q495T6	779 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	SLITRK3	O94933	977 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	TJP3	O95049	919 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	PGM3	O95394	542 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	FES	P07332	822 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	AR	P10275	920 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	MCL1	Q07820	350 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	MED21	Q13503	144 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ERCC3-208	ENST00000491292	FAXC	Q5TGI0	409 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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