RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TMIEQ8NEW7 156 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 INTS13Q9NVM9 706 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 IPPQ9Y573 584 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PROM1O43490 865 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHGA12O60330 932 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SUN1O94901 812 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CD1AP06126 327 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 FPGSQ05932 587 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ACAP2Q15057 778 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 KAT5Q92993 513 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 HDAC10Q969S8 669 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 FBXL20Q96IG2 436 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 UROC1Q96N76 676 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 MKS1Q9NXB0 559 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 JKAMPQ9P055 326 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.83□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 MPPED1O15442 326 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PROP1O75360 226 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SLC43A1O75387 559 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 DYRK1AQ13627 763 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 KAZNQ674X7 775 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ZNF365Q70YC5 407 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 MCM8Q9UJA3 840 aa5.82□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CCDC154A6NI56 674 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CGB1A6NKQ9 187 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ADM5C9JUS6 153 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SGTAO43765 313 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PPP3CBP16298 524 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TLE1Q04724 770 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ZNF844Q08AG5 666 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PDPRQ8NCN5 879 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 FBXO41Q8TF61 875 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 E9PLN8 166 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TOR1BO14657 336 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CHRM2P08172 466 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 GRIA3P42263 894 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SLC16A1P53985 500 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 KRTAP10-11P60412 298 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TXNRD1Q16881 649 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TIMP4Q99727 224 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.8□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 WIPF3A6NGB9 483 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 VWC2LB2RUY7 222 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 FZD9O00144 591 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 MYBL2P10244 700 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 RAB39AQ14964 217 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PTPRRQ15256 657 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 COA7Q96BR5 231 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 SARAFQ96BY9 339 aa5.79□□□□□ -1.48
SSB-211ENST00000490914 TEKT5Q96M29 485 aa5.79□□□□□ -1.48
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