RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 NRCAMQ92823 1304 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 C9IYK1 514 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 DDAH1O94760 285 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNA2P16389 499 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 GNAQP50148 359 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MGAT3Q09327 533 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 BBS9Q3SYG4 887 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 EPC2Q52LR7 807 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 TMTC2Q8N394 836 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SEPT8Q92599 483 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 APBB2Q92870 758 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SAMD11Q96NU1 681 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MYL10Q9BUA6 226 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIOO75962 3097 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 ENPP3O14638 875 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MAFGO15525 162 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 KIF5BP33176 963 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 PLA2G5P39877 138 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LIFRP42702 1097 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SOX9P48436 509 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 NECTIN1Q15223 517 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 NR0B2Q15466 257 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC14A2Q15849 920 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP6Q96JE9 813 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 PCYT2Q99447 389 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 SP110Q9HB58 689 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 JADE2Q9NQC1 790 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 EBF1Q9UH73 591 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 LAMA4Q16363 1823 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM82A0PJX8 343 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC27A2O14975 620 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 PRC1O43663 620 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 RB1P06400 928 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 MCM5P33992 734 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 BMPR1AP36894 532 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 LPIN1Q14693 890 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 NLRX1Q86UT6 975 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 FANCBQ8NB91 859 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 CUL5Q93034 780 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 IL17RAQ96F46 866 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 CDHR1Q96JP9 859 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 YME1L1Q96TA2 773 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR13Q9NZ81 148 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms