RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 GDPD5Q8WTR4 605 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 BTBD7Q9P203 1132 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 MYO7AQ13402 2215 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 DOCK2Q92608 1830 aa5.41□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 TMEM221A6NGB7 291 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PROB1E7EW31 1015 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 M0R296 226 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 NPTXRO95502 500 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 ARP10275 920 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PYGMP11217 842 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PDE6AP16499 860 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 FAHP16930 419 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 GJA4P35212 333 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 CDK7P50613 346 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 GCKRQ14397 625 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 GRB14Q14449 540 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 FIGNQ5HY92 759 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 VASNQ6EMK4 673 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 G2E3Q7L622 706 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 ADSSL1Q8N142 457 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 TMEM199Q8N511 208 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 FSD1Q9BTV5 496 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.4□□□□□ -1.54
CNN3-206ENST00000487539 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CEP250Q9BV73 2442 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CCDC66A2RUB6 948 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 LCHNA4D1U4 455 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 B4E1Z4 1266 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 PRDX5P30044 214 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 DNM2P50570 870 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ACLYP53396 1101 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 GRIN1Q05586 938 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ADAM9Q13443 819 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 PICALMQ13492 652 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 UBE4AQ14139 1066 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ST3GAL2Q16842 350 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 KSR2Q6VAB6 950 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 BRAPQ7Z569 592 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 STK32CQ86UX6 486 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 EDAQ92838 391 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 SCLYQ96I15 445 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CD244Q9BZW8 370 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 TMEM260Q9NX78 707 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 RFX7Q2KHR2 1363 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 LTFP02788 710 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 ADORA2AP29274 412 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 AVPR2P30518 371 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 BACE1P56817 501 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 SQSTM1Q13501 440 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 OSTM1Q86WC4 334 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 NEK9Q8TD19 979 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 SYT3Q9BQG1 590 aa5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CNN3-206ENST00000487539 IDI2Q9BXS1 227 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms