RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485623.5

ATG16L1-216, Transcript of autophagy related 16 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATG16L1, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1-216ENST00000485623 ZNF202O95125 648 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 C8AP07357 584 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 POU2F2P09086 479 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 ATF2P15336 505 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 TYMPP19971 482 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 KRBA2Q6ZNG9 492 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 SENP8Q96LD8 212 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 ZNF233A6NK53 670 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CYP11A1P05108 521 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 DPYDQ12882 1025 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 TPGS2Q68CL5 300 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 EDAQ92838 391 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CLIC2O15247 247 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 RHOBTB3O94955 611 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 SEC24AO95486 1093 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 PRR29P0C7W0 189 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 ZNF280DQ6N043 979 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 LRFN3Q9BTN0 628 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 DMAC2Q9NW81 257 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 MAFFQ9ULX9 164 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1-216ENST00000485623 CLUHO75153 1309 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 PTPRJQ12913 1337 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 KPNA7A9QM74 516 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 VNN2O95498 520 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 TAF6P49848 677 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 ZXDAP98168 799 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 PTPN21Q16825 1174 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 LIN9Q5TKA1 542 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 FAM84AQ96KN4 292 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 EXOC1Q9NV70 894 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 INTS13Q9NVM9 706 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 SIX4Q9UIU6 781 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 OR6C75A6NL08 312 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 CYB561D2O14569 222 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 CCL16O15467 120 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 ITGB3P05106 788 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 ODC1P11926 461 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 ARPP19P56211 112 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 GPR17Q13304 367 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 SURF1Q15526 300 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 OVOS1Q6IE37 1185 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 LRRC52Q8N7C0 313 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 RDH13Q8NBN7 331 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 MFSD14AQ96MC6 490 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 MYADMQ96S97 322 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 PIDD1Q9HB75 910 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16■□□□□ 0.15
ATG16L1-216ENST00000485623 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms