RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485526.1

VWDE-204, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 2

Gene VWDE, Length 573 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-204ENST00000485526 IL10RAQ13651 578 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 UAP1L1Q3KQV9 507 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 C3orf36Q3SXR2 165 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CLNKQ7Z7G1 428 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 AOPEPQ8N6M6 819 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SIMC1Q8NDZ2 872 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SSH3Q8TE77 659 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 WASF1Q92558 559 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 NELL1Q92832 810 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 KAT5Q92993 513 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 TMEM125Q96AQ2 219 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CLPTM1LQ96KA5 538 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 TLR10Q9BXR5 811 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 IPPQ9Y573 584 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa2.9□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 A0A1W2PS29 197 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 GABRDO14764 452 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PEX1O43933 1283 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SBK3P0C264 359 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 KCNA2P16389 499 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 KRT85P78386 507 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 TLE1Q04724 770 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PTPN21Q16825 1174 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ZNF365Q70YC5 407 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 LNX2Q8N448 690 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 IL17RDQ8NFM7 739 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 COA7Q96BR5 231 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 KLHL32Q96NJ5 620 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 HEPHQ9BQS7 1158 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 MAN1C1Q9NR34 630 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 JKAMPQ9P055 326 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SALL3Q9BXA9 1300 aa2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 FZD9O00144 591 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 TOR1BO14657 336 aa2.88□□□□□ -1.95
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VWDE-204ENST00000485526 ORC4O43929 436 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PRAMEF10O60809 474 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SLC43A1O75387 559 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CCND1P24385 295 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 EDNRBP24530 442 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ELLP55199 621 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ADKP55263 362 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 EVA1CP58658 441 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 RPS7P62081 194 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 AMPD3Q01432 767 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 FPGSQ05932 587 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 PIGFQ07326 219 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 FLYWCH1Q4VC44 716 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 MICALCLQ6ZW33 695 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 TTC7BQ86TV6 843 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ARHGEF25Q86VW2 580 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 Q8NA96 180 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 MRGPRX4Q96LA9 322 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 IMPG2Q9BZV3 1241 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 INTS13Q9NVM9 706 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 FOXJ2Q9P0K8 574 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SERPINB13Q9UIV8 391 aa2.88□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 YY2O15391 372 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 DTNBO60941 627 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 C1RP00736 705 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ANXA1P04083 346 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 GNAI3P08754 354 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SRGNP10124 158 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 SMARCA1P28370 1054 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 FOLR3P41439 243 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 RARRES1P49788 294 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CACNA2D1P54289 1103 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 GNAI1P63096 354 aa2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
VWDE-204ENST00000485526 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
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