RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 E5RI56 91 aa13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 FGFR4P22455 802 aa13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 CBX3Q13185 183 aa13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC126Q96EE4 140 aa13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 IFNL2Q8IZJ0 200 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TELO2Q9Y4R8 837 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TRIM62Q9BVG3 475 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TTLL1O95922 423 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 S100A12P80511 92 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PDHBP11177 359 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 EFCAB10A6NFE3 127 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 KRT36O76013 467 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 NCKAP1LP55160 1127 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 GJA10Q969M2 543 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 NUDT2P50583 147 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 JDP2Q8WYK2 163 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TP53INP1Q96A56 240 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 EXT2Q93063 718 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 HPS3Q969F9 1004 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 VAMP4O75379 141 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 LPIN1Q14693 890 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF284Q2VY69 593 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PRXQ9BXM0 1461 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 CHP2O43745 196 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 OSBPP22059 807 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PKP1Q13835 747 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ADSSL1Q8N142 457 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 EFHBQ8N7U6 833 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 MROH5Q6ZUA9 1318 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PROX1Q92786 737 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PSMD3O43242 534 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SH3BP4Q9P0V3 963 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 GIN1Q9NXP7 522 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 KIAA0232Q92628 1395 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ATP6V1C1P21283 382 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 FBXW4P57775 412 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 L1RE1Q9UN81 338 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 MTSS1O43312 755 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 VPS33AQ96AX1 596 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PRDM4Q9UKN5 801 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 NOD1Q9Y239 953 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ABCC1P33527 1531 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 TCF4P15884 667 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 RFC5P40937 340 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 KRT34O76011 436 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SPIRE1Q08AE8 756 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 FANCBQ8NB91 859 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 COBLO75128 1261 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 IFNA14P01570 189 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 POLR2MP0CAP2 368 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 RPS6KA3P51812 740 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 CDHR1Q96JP9 859 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 MEI1Q5TIA1 1274 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-207ENST00000481848 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms