RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 HINFPQ9BQA5 517 aa20.38■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 KRIT1O00522 736 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 KPNA6O60684 536 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 TOMM70O94826 608 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 TNNC2P02585 160 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 OSTNP61366 133 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 EMC10Q5UCC4 262 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 TRPV1Q8NER1 839 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 CPB2Q96IY4 423 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 A0A1B0GUA9 196 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 GABRQQ9UN88 632 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 CXCL8P10145 99 aa20.36■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 FLT3LGP49771 235 aa20.36■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.36■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 TRIB2Q92519 343 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 LRRC45Q96CN5 670 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 ZIM3Q96PE6 472 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.36■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 FAM153CQ494X1 144 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 THAP2Q9H0W7 228 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 ASB7Q9H672 318 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 HSPA6P17066 643 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 GJA9P57773 515 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 LACTBL1A8MY62 500 aa20.34■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.34■□□□□ 0.85
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SYF2-204ENST00000476231 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-204ENST00000476231 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.33■□□□□ 0.84
SYF2-204ENST00000476231 TREHO43280 583 aa20.33■□□□□ 0.84
SYF2-204ENST00000476231 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYF2-204ENST00000476231 PRKCZQ05513 592 aa20.33■□□□□ 0.84
SYF2-204ENST00000476231 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.33■□□□□ 0.84
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