RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 VPS36Q86VN1 386 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 WDR49Q8IV35 697 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KSR1Q8IVT5 923 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 FIBCD1Q8N539 461 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 EDAQ92838 391 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 APBB2Q92870 758 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 PGBD4Q96DM1 585 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 STK33Q9BYT3 514 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TMX1Q9H3N1 280 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KCND1Q9NSA2 647 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 RAB20Q9NX57 234 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 C2CD2Q9Y426 696 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TECTAO75443 2155 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CARNS1A5YM72 827 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 MBTPS2O43462 519 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF623O75123 536 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 PHACTR2O75167 634 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 EOMESO95936 686 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 P4HA1P13674 534 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 FERP16591 822 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CYP3A5P20815 502 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 PON1P27169 355 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ATICP31939 592 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CASP14P31944 242 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CTNNB1P35222 781 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 BMPR1AP36894 532 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 LTBRP36941 435 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 GRM5P41594 1212 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 STAT1P42224 750 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 MXI1P50539 228 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KCNMA1Q12791 1236 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TRPC3Q13507 836 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 HIC1Q14526 733 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KIZQ2M2Z5 673 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 PACS2Q86VP3 889 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 RNF135Q8IUD6 432 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SPAG5Q96R06 1193 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 DNAJC7Q99615 494 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 COL4A6Q14031 1691 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KAT6AQ92794 2004 aa7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TTC26A0AVF1 554 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 TSPAN1O60635 241 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 OFD1O75665 1012 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SERPING1P05155 500 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 STAG3L1P0CL83 205 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 UCHL3P15374 230 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 FECHP22830 423 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 ACOT2P49753 483 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 RBP5P82980 135 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 MYL7Q01449 175 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 GCNT1Q02742 428 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 HYAL1Q12794 435 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SPA17Q15506 151 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms