RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 CAND2O75155 1236 aa19.96■□□□□ 0.79
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CAPN3-209ENST00000466222 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 NT5C1BQ96P26 610 aa19.94■□□□□ 0.78
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CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 CNTN3Q9P232 1028 aa19.94■□□□□ 0.78
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CAPN3-209ENST00000466222 PTGESO14684 152 aa19.92■□□□□ 0.78
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CAPN3-209ENST00000466222 MIOSQ9NXC5 875 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 DPP3Q9NY33 737 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 AIPL1Q9NZN9 384 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 C2CD2Q9Y426 696 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 A0A0U1RQF3 1178 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF263O14978 683 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPN3-209ENST00000466222 ASS1P00966 412 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
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