RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 DCLK2Q8N568 766 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 KIF12Q96FN5 646 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PNMA5Q96PV4 448 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PLIN2Q99541 437 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 KIF2CQ99661 725 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CEP72Q9P209 647 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CEP250Q9BV73 2442 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 M0QZQ0 153 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CYP3A5P20815 502 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 LRPAP1P30533 357 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 GDI1P31150 447 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 LIG4P49917 911 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 EPHA5P54756 1037 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SLC12A3P55017 1021 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 NCKAP1LP55160 1127 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SPAG1Q07617 926 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MTAPQ13126 283 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PPP2R5DQ14738 602 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 KYAT1Q16773 422 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 VITQ6UXI7 678 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 USP37Q86T82 979 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 IER2Q9BTL4 223 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 GPR88Q9GZN0 384 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 YIPF1Q9Y548 306 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TTC26A0AVF1 554 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 H3BQV1 296 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF263O14978 683 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 OAZ2O95190 189 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SCP2P22307 547 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 FZD5Q13467 585 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TEAD2Q15562 447 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TSSK4Q6SA08 328 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 MAP4K3Q8IVH8 894 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 FAM3CQ92520 227 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 NELL1Q92832 810 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 E2F7Q96AV8 911 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 EPC1Q9H2F5 836 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 OR6C75A6NL08 312 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SHISA7A6NL88 538 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 LILRB5O75023 590 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 MOSPD3O75425 235 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 GJA1P17302 382 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TNFSF9P41273 254 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 VIPR2P41587 438 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 EPHB3P54753 998 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 NRLP54845 237 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ZBTB6Q15916 424 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 YAF2Q8IY57 180 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 BEST2Q8NFU1 509 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 AK8Q96MA6 479 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 CHRDQ9H2X0 955 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SCN1AP35498 2009 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 LACTBL1A8MY62 500 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 K7ENM7 598 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 OGTO15294 1046 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SLC26A4O43511 780 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 OR4Q2P0C623 313 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ODC1P11926 461 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 SDHBP21912 280 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 ALDH1A3P47895 512 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-214ENST00000465399 CCR3P51677 355 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms