RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNOCQ13519 176 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UVSSAQ2YD98 709 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPPQ6IPU0 288 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR49Q8IV35 697 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NELFCDQ8IXH7 590 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HASPINQ8TF76 798 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDE11AQ9HCR9 933 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.14□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GOLGA8IPA6NC78 632 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GOLGA8JA6NMD2 632 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 I3L4J1 428 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2CD2LO14523 706 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAM12O43184 909 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSPG5O95196 566 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMC2O95347 1197 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLUD1P00367 558 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM163BP0C2L3 166 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL9P15248 144 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNPLA4P41247 253 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GUCY2FP51841 1108 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP24A1Q07973 514 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DUOXA2Q1HG44 320 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EDRF1Q3B7T1 1238 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR149Q86SP6 731 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM130Q8N3G9 435 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA18Q8TC71 538 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARD3BQ8TEW8 1205 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM212AQ96EL1 285 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NECTIN4Q96NY8 510 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SIX4Q9UIU6 781 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXW11Q9UKB1 542 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGA11Q9UKX5 1188 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPRJQ12913 1337 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCN1AP35498 2009 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H7C4K7 107 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IKBKBO14920 756 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KINO60870 393 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NR3C1P04150 777 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATF2P15336 505 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL17P18621 184 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMP6P22004 513 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXA9P31269 272 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCM4P33991 863 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF6P49848 677 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AP3M2P53677 418 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBP5P82980 135 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZP2Q05996 745 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TPGS2Q68CL5 300 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP57Q86XR8 500 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADHFE1Q8IWW8 467 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADSSL1Q8N142 457 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR5B17Q8NGF7 314 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHO2Q8TD55 490 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMC2Q8TDI7 906 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF516Q92618 1163 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SENP8Q96LD8 212 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SFXN1Q9H9B4 322 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KPNA7A9QM74 516 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LOC730098B7Z3J9 87 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EXOC3O60645 756 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZMYND10O75800 440 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1D2P34982 312 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRCPP42785 496 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTHFRP42898 656 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR17Q13304 367 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MORC3Q14149 939 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCARA3Q6AZY7 606 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LLGL2Q6P1M3 1020 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DPH6Q7L8W6 267 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KREMEN2Q8NCW0 462 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCE1Q969G3 411 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms