RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 THAP9Q9H5L6 903 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 APPL1Q9UKG1 709 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 POFUT2Q9Y2G5 429 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 B4E1Z4 1266 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK3O14649 394 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CFBP00751 764 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-FP30511 346 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 ETFBP38117 255 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TBX4P57082 545 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC63Q05C16 580 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TRAF2Q12933 501 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CDC16Q13042 620 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF846Q147U1 533 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SCFD2Q8WU76 684 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC12Q9UKB3 198 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 BTBD19C9JJ37 291 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 H0YCG3 227 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 M0QZ92 97 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB5O15062 677 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HEXBP07686 556 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 TNNI1P19237 187 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PCP4P48539 62 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NPEPPSP55786 919 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DPYSQ14117 519 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 POTEAQ6S8J7 498 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DCTPP1Q9H773 170 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 AIPL1Q9NZN9 384 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 BTN3A1O00481 513 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 PLTPP55058 493 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC14Q15048 493 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PKN1Q16512 942 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 FAM76BQ5HYJ3 339 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TREML1Q86YW5 311 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 STX19Q8N4C7 294 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 FANK1Q8TC84 345 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 OTULINQ96BN8 352 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SETDB2Q96T68 719 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GBA3Q9H227 469 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1257Q9ULG3 409 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 FAM92AA1XBS5 289 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PSTPIP1O43586 416 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SRGAP2O75044 1071 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GPC4O75487 556 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GNAI3P08754 354 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT7P0C024 238 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN4P29074 926 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SFNP31947 248 aa5.85□□□□□ -1.47
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