RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 POTEHQ6S545 545 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 FOXQ1Q9C009 403 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 STK17AQ9UEE5 414 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ANK1P16157 1881 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 OR6C75A6NL08 312 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 GLULP15104 373 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 FCARP24071 287 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA9P43362 315 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TWF1Q12792 350 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 DNASE1L2Q92874 299 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 HVCN1Q96D96 273 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 PATJQ8NI35 1801 aa22.79■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CCR2P41597 374 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 PLD1Q13393 1074 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MYBPC2Q14324 1141 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SPECC1Q5M775 1068 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 USP37Q86T82 979 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 EPSTI1Q96J88 318 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ASB16Q96NS5 453 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ASB7Q9H672 318 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CEP72Q9P209 647 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD2Q9Y426 696 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CLIC4Q9Y696 253 aa22.78■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 COL4A3Q01955 1670 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 COL4A2P08572 1712 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 LILRA4P59901 499 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 GPR17Q13304 367 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 JADE1Q6IE81 842 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ASAH2Q9NR71 780 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 YIPF1Q9Y548 306 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.77■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ANO9A1A5B4 782 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 PIRO00625 290 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 MOSPD3O75425 235 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R37O75864 691 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 VNN2O95498 520 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ODC1P11926 461 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 RESTQ13127 1097 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.76■■□□□ 1.23
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LIMS1-208ENST00000428064 NELL2Q99435 816 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 BCO2Q9BYV7 579 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.76■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 PPEF2O14830 753 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CYP11A1P05108 521 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 NFICP08651 508 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SYT1P21579 422 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 GUCY2FP51841 1108 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ADALQ6DHV7 355 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 USP49Q70CQ1 688 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCD2Q92925 531 aa22.75■■□□□ 1.23
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LIMS1-208ENST00000428064 GPR88Q9GZN0 384 aa22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SP9P0CG40 484 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TXLNAP40222 546 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SFR1Q86XK3 245 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN23Q96B33 292 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 BORCS6Q96GS4 357 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SENP8Q96LD8 212 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC3Q9BY71 257 aa22.74■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR11A4FU01 709 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 FAM170BA6NMN3 283 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SPTLC1O15269 473 aa22.73■■□□□ 1.23
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