RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CHST7Q9NS84 486 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 KPNA7A9QM74 516 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SYN3O14994 580 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GRM6O15303 877 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LPXNO60711 386 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PHACTR2O75167 634 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 HLA-DRAP01903 254 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 BRCC3P46736 316 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 MYO1EQ12965 1108 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TRPC3Q13507 836 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CAMK1Q14012 370 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 KRT31Q15323 416 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 POF1BQ8WVV4 589 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 HPDLQ96IR7 371 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ZBP1Q9H171 429 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FGFR3P22607 806 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PIK3CAP42336 1068 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 MYL6P60660 151 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 MYL7Q01449 175 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 VWA3BQ502W6 1294 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 NDST4Q9H3R1 872 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 RAB20Q9NX57 234 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CYP11A1P05108 521 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CTSAP10619 480 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ATP1A3P13637 1013 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 DNAJB1P25685 340 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 USP41Q3LFD5 358 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SENP8Q96LD8 212 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TLR9Q9NR96 1032 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 IRAK3Q9Y616 596 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FSCN2O14926 492 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TYMPP19971 482 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SCN1AP35498 2009 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TPM4P67936 248 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 DSG1Q02413 1049 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CETN1Q12798 172 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GRIN2CQ14957 1233 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF699Q32M78 642 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 DPH6Q7L8W6 267 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 VPS52Q8N1B4 723 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LMO3Q8TAP4 145 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SEMA4DQ92854 862 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 I3L4J1 428 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 RTP2Q5QGT7 225 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SPATA18Q8TC71 538 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TTPALQ9BTX7 342 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LILRB3O75022 631 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FAM163BP0C2L3 166 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ODC1P11926 461 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GLUD2P49448 558 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 ERVFC1P60507 584 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 APPL2Q8NEU8 664 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 DSEQ9UL01 958 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 RFXAPO00287 272 aa21.88■■□□□ 1.09
TSTA3-201ENST00000425753 CYB561D2O14569 222 aa21.88■■□□□ 1.09
TSTA3-201ENST00000425753 LRRN2O75325 713 aa21.88■■□□□ 1.09
TSTA3-201ENST00000425753 URODP06132 367 aa21.88■■□□□ 1.09
TSTA3-201ENST00000425753 PTPN14Q15678 1187 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms