RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.11
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.36□□□□□ -0.11
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYIQ5T013 277 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YAF2Q8IY57 180 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNMA5Q96PV4 448 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTKNQ9BST9 563 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.33□□□□□ -0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCND2Q9NZV8 630 aa14.33□□□□□ -0.12
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