RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CDK17Q00537 523 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LRRC4Q9HBW1 653 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SYBUQ9NX95 663 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 GGA2Q9UJY4 613 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SAMD9Q5K651 1589 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 K7ERI5 159 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SERPINB5P36952 375 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RGS2P41220 211 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 VPS50Q96JG6 964 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 BBS2Q9BXC9 721 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TLR10Q9BXR5 811 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CDY2AQ9Y6F7 541 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CDY1Q9Y6F8 540 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PSMG1O95456 288 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 BMP3P12645 472 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SERPINB9P50453 376 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ARMC3Q5W041 872 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RUBCNLQ9H714 662 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 AP3B1O00203 1094 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ATP9BO43861 1147 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SNX2O60749 519 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TRIM72Q6ZMU5 477 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PNMA3Q9UL41 463 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 GRID1Q9ULK0 1009 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 A8MXQ7 604 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RIPK2O43353 540 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 USP1O94782 785 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 BGNP21810 368 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CENPCQ03188 943 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 AP3B2Q13367 1082 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MAPK11Q15759 364 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 GLMNQ92990 594 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 NDNQ99608 321 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MTRQ99707 1265 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ATP7AQ04656 1500 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ENTPD5O75356 428 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TNFAIP8O95379 198 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SDC4P31431 198 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K10Q02779 954 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SIX5Q8N196 739 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MEI4A8MW99 385 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 FCHO1O14526 889 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB5O15062 677 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SNX3O60493 162 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V1C1P21283 382 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ABCD1P33897 745 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PRELPP51888 382 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TMPRSS6Q8IU80 811 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 JADE3Q92613 823 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 KAT2BQ92831 832 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TASP1Q9H6P5 420 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 DENND3A2RUS2 1198 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PGM3O95394 542 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RUNX1T1Q06455 604 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ST3GAL1Q11201 340 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TFDP1Q14186 410 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 DOK7Q18PE1 504 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CEP78Q5JTW2 689 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TLK2Q86UE8 772 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms