RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 FZD8Q9H461 694 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 HPS4Q9NQG7 708 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 LHX6Q9UPM6 363 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 YIPF1Q9Y548 306 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYLKQ15746 1914 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPEF2O14830 753 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF263O14978 683 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASAP2O43150 1006 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MED24O75448 989 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 EGFP01133 1207 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAPNS1P04632 268 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATF2P15336 505 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GUCY2FP51841 1108 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOSBP53539 338 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 OSTNP61366 133 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM193AP78312 1265 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPAG1Q07617 926 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TFDP1Q14186 410 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ECM1Q16610 540 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEZ6Q53EL9 994 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEK8Q86SG6 692 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FRMD1Q8N878 549 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB124Q8NES8 71 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFRSF25Q93038 417 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BORCS6Q96GS4 357 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSD17B14Q9BPX1 270 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPV5Q9NQA5 729 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCL26Q9Y258 94 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAST4O15021 2626 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUMA1Q14980 2115 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PODXLO00592 558 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABLIM1O14639 778 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 N4BP3O15049 544 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHADO15335 359 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF40O75150 1001 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DGAT1O75907 488 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 LYPLA2O95372 231 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTDNEP1O95476 244 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARSAP15289 507 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSPA4P34932 840 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 EVCP57679 992 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGD1P98174 961 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 POU5F1BQ06416 359 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 AAMPQ13685 434 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM187BQ17R55 369 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALKAL1Q6UXT8 129 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL26A1Q96A83 441 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRELD1Q96HD1 420 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM20AQ96MK3 541 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 IER2Q9BTL4 223 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HAPLN2Q9GZV7 340 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDT1Q9H211 546 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL21Q9HBE4 155 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms