RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 MXRA7P84157 204 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 GPR149Q86SP6 731 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 MFSD3Q96ES6 412 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 FEZ1Q99689 392 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 WNT10BO00744 389 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 BPIP17213 487 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 UBXN4Q92575 508 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 RSAD1Q9HA92 442 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 PIK3C2GO75747 1445 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 EP400Q96L91 3159 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 UGT8Q16880 541 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 OR7D4Q8NG98 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 CAGE1Q8TC20 777 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 TLK1Q9UKI8 766 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 RGS12O14924 1447 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 MYOM2P54296 1465 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 A0A087X0B3 334 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 CDK4P11802 303 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZVL8 140 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 Q96MF0 132 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 PRAM1Q96QH2 718 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 BCO1Q9HAY6 547 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ATRNO75882 1429 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF10O15013 1369 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 CDC45O75419 566 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 C1RP00736 705 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ENPP1P22413 925 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 PTPN7P35236 360 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZNX1 250 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 MED25Q71SY5 747 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 GPR156Q8NFN8 814 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ACAP3Q96P50 834 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 DUSP26Q9BV47 211 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 SCOCQ9UIL1 159 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 IFT172Q9UG01 1749 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 SBNO1A3KN83 1393 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-204ENST00000367379 KIF1AQ12756 1690 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRC-204ENST00000367379 IGLV2-14P01704 120 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 RARRES1P49788 294 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 DRC7Q8IY82 874 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 TSPEARQ8WU66 669 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 DRC1Q96MC2 740 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 DPP7Q9UHL4 492 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 EDARQ9UNE0 448 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-204ENST00000367379 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.46□□□□□ -1.38
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