RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CDH18Q13634 790 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KRT33BQ14525 404 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GBP6Q6ZN66 633 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GPR152Q8TDT2 470 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A5Q92911 643 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ABCG4Q9H172 646 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY26PQ9H489 355 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQ27 194 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQ64 194 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQD8 194 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01553A4QN01 128 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DCXO43602 365 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLITRK3O94933 977 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CSH1P0DML2 217 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CSH2P0DML3 217 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MCF2P10911 925 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB4P21439 1286 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RGS7P49802 495 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EFEMP1Q12805 493 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NME3Q13232 169 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR3Q13615 1198 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NCOA4Q13772 614 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NPY5RQ15761 445 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CDO1Q16878 200 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SDHAF4Q5VUM1 108 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM228AQ86W67 206 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CHSY1Q86X52 802 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NAT16Q8N8M0 369 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SUSD6Q92537 303 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 IRF7Q92985 503 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR8Q96EF0 704 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SYT15Q9BQS2 421 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PPME1Q9Y570 386 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RQF3 1178 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A8A0AV02 714 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 OR4Q2P0C623 313 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MSNP26038 577 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LHX1P48742 406 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MFAP3P55082 362 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 BPIFB4P59827 614 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 Q4G0T1 1027 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DENND2CQ68D51 928 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM124AQ86V42 546 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TBX21Q9UL17 535 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TBX20Q9UMR3 447 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PSME4Q14997 1843 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 COL1A2P08123 1366 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y626 953 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 M0QYV0 167 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 WNT7AO00755 349 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ASMTLO95671 621 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM49P0CI25 452 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM49CP0CI26 452 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GLRA2P23416 452 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GRIN1Q05586 938 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TWF1Q12792 350 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PNOCQ13519 176 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 E2F5Q15329 346 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.73□□□□□ -1.65
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