RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 HVCN1Q96D96 273 aa24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM84AQ96KN4 292 aa24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 GCNT3O95395 438 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRG1P02750 347 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPB1P15086 417 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEBPBP17676 345 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 GAP43P17677 238 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELF1P32519 619 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRE11P49959 708 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 E2F4Q16254 413 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 BEST2Q8NFU1 509 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 HPS3Q969F9 1004 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 NXPE3Q969Y0 559 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCEAL4Q96EI5 215 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM209Q96SK2 561 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 H0Y858 1186 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 OAZ2O95190 189 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABCD1P33897 745 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 LILRA4P59901 499 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SHC4Q6S5L8 630 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 RTL10Q7L3V2 364 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SAAL1Q96ER3 474 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 KXD1Q9BQD3 176 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CORO1BQ9BR76 489 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PANK4Q9NVE7 773 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANO9A1A5B4 782 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIRO00625 290 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP6R2O75170 966 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCR2P41597 374 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLCN5P51795 746 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDR1P51861 262 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPGS2Q68CL5 300 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD302Q8IX05 232 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 SENP8Q96LD8 212 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACCSQ96QU6 501 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRRX2Q99811 253 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP72Q9P209 647 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 WNT16Q9UBV4 365 aa24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACNA1HO95180 2353 aa24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIEZO1Q92508 2521 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 YEATS4O95619 227 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 F13A1P00488 732 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 AOC1P19801 751 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPC5P78333 572 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 TWF1Q12792 350 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 DHX58Q96C10 678 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASB7Q9H672 318 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 DERAQ9Y315 318 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 COL4A2P08572 1712 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPN2P17706 415 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 DPP3Q9NY33 737 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 C2CD2Q9Y426 696 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 YIPF1Q9Y548 306 aa24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 TYMPP19971 482 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP37Q86T82 979 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D17Q9HA65 648 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 CUTAO60888 179 aa24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 MOSPD3O75425 235 aa24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25-201ENST00000348333 ODC1P11926 461 aa24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms